RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 IGHV3-7P01780 117 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 CELA3BP08861 270 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 HOXC12P31275 282 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 CHRNA7P36544 502 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 PMELP40967 661 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 HGFACQ04756 655 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 FBLN7Q53RD9 439 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 RAB18Q9NP72 206 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 IFI6P09912 130 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 GLIPR1P48060 266 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF787Q6DD87 383 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 OR10C1Q96KK4 312 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 NCKAP5O14513 1909 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 H0Y8G0 127 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 CST7O76096 145 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 VAMP5O95183 116 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 FCGR3AP08637 254 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 AMTP48728 403 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 ZP4Q12836 540 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 LRP5LA4QPB2 252 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 CD33P20138 364 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 MPZP25189 248 aa7.41□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 TCF15Q12870 199 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 SPATA45Q537H7 98 aa7.41□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 OR4X1Q8NH49 305 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.41□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 TNFSF4P23510 183 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 ZBTB25P24278 435 aa7.41□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 ROM1Q03395 351 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 CSRP2Q16527 193 aa7.41□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 LYZL4Q96KX0 146 aa7.41□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.41□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 C21orf140B9A014 251 aa7.4□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 RND3P61587 244 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 SP6Q3SY56 376 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.4□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 A0A1B0GTI1 187 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 B4DEV8 164 aa7.4□□□□□ -1.22
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ACTBP13-201ENST00000423971 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 UNC119Q13432 240 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 P2RY6Q15077 328 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM78BQ5VT40 261 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 VWA1Q6PCB0 445 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTBP13-201ENST00000423971 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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