RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ZNF488Q96MN9 340 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 OOEPA6NGQ2 149 aa8.49□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 STARD6P59095 220 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM45BQ96B21 275 aa8.49□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 LHX9Q9NQ69 397 aa8.49□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.48□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.48□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 NGBQ9NPG2 151 aa8.48□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 F8VWA3 439 aa8.48□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 PRNTQ86SH4 94 aa8.48□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.48□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.48□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MARCH11A6NNE9 402 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 H0YIZ8 118 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 CISD3P0C7P0 127 aa8.48□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 ASCL3Q9NQ33 180 aa8.48□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.47□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 C3orf80F5H4A9 247 aa8.47□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 CEACAM1P13688 526 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ICAM4Q14773 271 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 PERPQ96FX8 193 aa8.47□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPC4 97 aa8.47□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 THY1P04216 161 aa8.47□□□□□ -1.05
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HERC3-202ENST00000402738 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 UNC119Q13432 240 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TCF23Q7RTU1 214 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 A6NJY4 79 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MPDU1O75352 247 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 DRD3P35462 400 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 CCL11P51671 97 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 UCP3P55916 312 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 OR2M3Q8NG83 312 aa8.46□□□□□ -1.05
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