RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 CCL8P80075 99 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 FAM219AQ8IW50 185 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 YPEL2Q96QA6 119 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 KCNJ16Q9NPI9 418 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-202ENST00000395322 ARID1AO14497 2285 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ICE1Q9Y2F5 2266 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 LGALS8O00214 317 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ITGB1BP1O14713 200 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 SIGLEC5O15389 551 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 KCNAB3O43448 404 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 RAB7AP51149 207 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM33P57088 247 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 RNF141Q8WVD5 230 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 GAFA1Q96PS6 74 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 GPHA2Q96T91 129 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 CALYQ9NYX4 217 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 FBXL17Q9UF56 701 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ATMQ13315 3056 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 E7EQL1 145 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 PPIAL4DF5H284 164 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 GPR12P47775 334 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ID3Q02535 119 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 BAXQ07812 192 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 OR2C3Q8N628 320 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 PIEZO1Q92508 2521 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 COA4Q9NYJ1 87 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 PPIAL4AQ9Y536 164 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 hADV38S2A0JD32 116 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 SSSCA1O60232 199 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 PITX3O75364 302 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 CLDN1O95832 211 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 EPHA1P21709 976 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 CAV2P51636 162 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ADORA2A-AS1P86434 159 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF266Q14584 549 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 AANATQ16613 207 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 MORN2Q502X0 79 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 FAM201AQ5SY85 155 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 RFESDQ8TAC1 157 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 CXorf58Q96LI9 332 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 RAB40CQ96S21 281 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 RNF150Q9ULK6 438 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 PSG11Q9UQ72 335 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 NUDT19A8MXV4 375 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM178BH3BS89 294 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 I3L521 148 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 TMPRSS2O15393 492 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 GYPAP02724 150 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 LPAR6P43657 344 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF585BQ52M93 769 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 DEFB108BQ8NET1 73 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 LINC01560Q8TB33 94 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 TMED6Q8WW62 240 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 CORO2AQ92828 525 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 GPR146Q96CH1 333 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-202ENST00000395322 CCL13Q99616 98 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms