RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384569.1

SNORD56.6-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMEM65Q6PI78 240 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TEX261Q6UWH6 196 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 BTNL3Q6UXE8 466 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 LYZL2Q7Z4W2 148 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 STX12Q86Y82 276 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR8H3Q8N146 312 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 C18orf12Q96KH6 178 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR10C1Q96KK4 312 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMEM56Q96MV1 263 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CLCC1Q96S66 551 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 S1PR3Q99500 378 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SHARPINQ9H0F6 387 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TAS2R3Q9NYW6 316 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 NSG2Q9Y328 171 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 POMT1Q9Y6A1 747 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SESN1Q9Y6P5 492 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 U3KQ87 197 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 A0A1W2PPE2 198 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 A0A1W2PR64 198 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 A0A1W2PRV1 198 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 RNF222A6NCQ9 220 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 MPTX1A8MV57 137 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 C15orf65H3BRN8 121 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 M0R1X1 148 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TAAR5O14804 337 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SIAH2O43255 324 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 PPIHO43447 177 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 GPR137BO60478 399 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 YPEL1O60688 119 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CLDN1O95832 211 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 APOA2P02652 100 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 THBS3P49746 956 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CAV2P51636 162 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 IFITM2Q01629 132 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 RTL8BQ17RB0 113 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 FAM219AQ8IW50 185 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 LYG1Q8N1E2 194 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR4S2Q8NH73 311 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 RFESDQ8TAC1 157 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 LHFPL5Q8TAF8 219 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ST8SIA2Q92186 375 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 RAB1CQ92928 201 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 PHYHIPLQ96FC7 376 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 AQP10Q96PS8 301 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 YPEL2Q96QA6 119 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 DCTN5Q9BTE1 182 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 DCAF16Q9NXF7 216 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CLN8Q9UBY8 286 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CACNG5Q9UF02 275 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 A0A1B0GU03 582 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 A6NNC1 897 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 B8ZZF3 427 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 DVL1O14640 695 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ITGB1BP1O14713 200 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 RAB29O14966 203 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 GPR37O15354 613 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 FCGR3BO75015 233 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 MED6O75586 246 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 S1PR2O95136 353 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 NXPH3O95157 252 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms