RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 MOSP00540 346 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 GSTT2P0CG29 244 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 GSTT2BP0CG30 244 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB25P24278 435 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 CEACAM6P40199 344 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ARFRP1Q13795 201 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 IGSF11Q5DX21 431 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 Q8N9W7 124 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 PLSCR3Q9NRY6 295 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ITGB1BP1O14713 200 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 BET1O15155 118 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 RPS19P39019 145 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 F2RL1P55085 397 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 NCS1P62166 190 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF260Q3ZCT1 412 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 RDH8Q9NYR8 311 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 PIPOXQ9P0Z9 390 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ETV7Q9Y603 341 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 RAB29O14966 203 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CNTFRP26992 372 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 SCAND1P57086 179 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 KIR2DS1Q14954 304 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 C2orf68Q2NKX9 166 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 HACD4Q5VWC8 232 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 RITA1Q96K30 269 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 TOLLIPQ9H0E2 274 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 RNF150Q9ULK6 438 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA2Q9UM82 520 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 LINC01548A6NM66 108 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 SSX5O60225 188 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 PROP1O75360 226 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 SCGNO76038 276 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CSF1P09603 554 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CT45A6P0DMU7 189 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CT45A5P0DMU8 189 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CT45A7P0DMV0 189 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 DTYMKP23919 212 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 TALDO1P37837 337 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 VBP1P61758 197 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ARL6IP1Q15041 203 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 OR5AU1Q8NGC0 362 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 S1PR3Q99500 378 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 MMP27Q9H306 513 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 IGHG2P01859 326 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 SERPINB10P48595 397 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00205P59089 165 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 GNG2P59768 71 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ACTBP60709 375 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 MMDQ15546 238 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZS49 121 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 SLC35E3Q7Z769 313 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 C5orf30Q96GV9 206 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 HSPB9Q9BQS6 159 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ABCG5Q9H222 651 aa11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 H0YJW9 148 aa11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 PTHLHP12272 177 aa11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 GPR12P47775 334 aa11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CD83Q01151 205 aa11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 OR8H1Q8NGG4 311 aa11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 OR2D2Q9H210 308 aa11.79□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PRX2 142 aa11.78□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 DIRAS3O95661 229 aa11.78□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 OR8U9P0C7N5 309 aa11.78□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.78□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF329Q86UD4 541 aa11.78□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.78□□□□□ -0.52
CSAG1-201ENST00000361211 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms