RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ZNF525Q8N782 197 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR4C12Q96R67 309 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RSG1Q9BU20 258 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ST8SIA5O15466 376 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 FCGR3BO75015 233 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 FABP4P15090 132 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 HGFACQ04756 655 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 DRAM1Q8N682 238 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 NECAP1Q8NC96 275 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPQ1 181 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SMPD2O60906 423 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 B2MP61769 119 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RHOBP62745 196 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 Q0VFX4 171 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TINAGQ9UJW2 476 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 PINLYPA6NC86 204 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 C11orf94C9JXX5 98 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 IL3RAP26951 378 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 NEURL1O76050 574 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SCGB1D1O95968 90 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 PGA5P0DJD9 388 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 HOXA5P20719 270 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SPCS3P61009 180 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 C4orf17Q53FE4 359 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 DHRS13Q6UX07 377 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 UBALD1Q8TB05 177 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 OR5H1A6NKK0 313 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 M0R1B8 84 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SLC35E1Q96K37 410 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 HES7Q9BYE0 225 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 XKRY2A2RUG3 117 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 GDF9O60383 454 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 KBTBD11O94819 623 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 VENTXO95231 258 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 CXorf1O96002 111 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SOX8P57073 446 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 COL10A1Q03692 680 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ZNF90Q03938 601 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 COX19Q49B96 90 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RNF2Q99496 336 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PR80 420 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ZNF320A2RRD8 509 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 M0R296 226 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 GYPAP02724 150 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 P2RY6Q15077 328 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ACY3Q96HD9 319 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 GGACTQ9BVM4 153 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 NGBQ9NPG2 151 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RPRMQ9NS64 109 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 MGST3O14880 152 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 CELA3AP09093 270 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 PKIAP61925 76 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 AESQ08117 197 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 IQCJQ1A5X6 159 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 OR1L1Q8NH94 360 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SNX22Q96L94 193 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 JPT1Q9UK76 154 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms