RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 OR4C45A6NMZ5 311 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 CPN1P15169 458 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 DHRS2Q13268 280 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 CEBPEQ15744 281 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 U3KQ87 197 aa11.66□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 ERVH48-1M5A8F1 160 aa11.65□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 WNT5AP41221 380 aa11.65□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 SLC25A28Q96A46 364 aa11.65□□□□□ -0.54
PDGFRB-201ENST00000261799 ZG16O60844 167 aa11.65□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 WDR73Q6P4I2 378 aa11.65□□□□□ -0.54
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PDGFRB-201ENST00000261799 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.65□□□□□ -0.55
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PDGFRB-201ENST00000261799 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.65□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 TM4SF5O14894 197 aa11.64□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 VSIG8P0DPA2 414 aa11.64□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 SNAI3Q3KNW1 292 aa11.64□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.64□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 OVCH2Q7RTZ1 564 aa11.64□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 C8orf46Q8TAG6 207 aa11.64□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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PDGFRB-201ENST00000261799 C10orf128Q5T292 105 aa11.64□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM18Q96B42 140 aa11.64□□□□□ -0.55
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PDGFRB-201ENST00000261799 IL18BPO95998 194 aa11.63□□□□□ -0.55
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PDGFRB-201ENST00000261799 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.62□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.62□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 DLL3Q9NYJ7 618 aa11.62□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 TRPM6Q9BX84 2022 aa11.62□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM189A5PLL7 270 aa11.62□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 IGKV1D-33P01593 117 aa11.62□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 IGKV1-33P01594 117 aa11.62□□□□□ -0.55
PDGFRB-201ENST00000261799 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
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