RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 YPEL1O60688 119 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 CLDN12P56749 244 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 HMGN3Q15651 99 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 SVOPQ8N4V2 548 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 Q8N9W7 124 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 OR51D1Q8NGF3 324 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 OR8H1Q8NGG4 311 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 YPEL2Q96QA6 119 aa22.92■■□□□ 1.26
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SEMA3B-215ENST00000621029 V9GY05 133 aa22.91■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 TGP01266 2768 aa22.91■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 NOTCH3Q9UM47 2321 aa22.91■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 LINC01548A6NM66 108 aa22.9■■□□□ 1.26
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SEMA3B-215ENST00000621029 ATP6V1G2O95670 118 aa22.9■■□□□ 1.26
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SEMA3B-215ENST00000621029 STPG2Q8N412 459 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 AK3Q9UIJ7 227 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-215ENST00000621029 NUDT19A8MXV4 375 aa22.89■■□□□ 1.25
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SEMA3B-215ENST00000621029 IGLL1P15814 213 aa22.89■■□□□ 1.25
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SEMA3B-215ENST00000621029 HES5Q5TA89 166 aa22.89■■□□□ 1.25
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SEMA3B-215ENST00000621029 OR3A3P47888 321 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 F2RL1P55085 397 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 C2orf76Q3KRA6 126 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 WFDC9Q8NEX5 89 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 PDCD5O14737 125 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 MMDQ15546 238 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 SSX1Q16384 188 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM89BQ8N5H3 189 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 COMMD1Q8N668 190 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 PHF21AQ96BD5 680 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 GON7Q9BXV9 100 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 ST8SIA5O15466 376 aa22.86■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 DENRO43583 198 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF880Q6PDB4 577 aa22.86■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 ODF3L1Q8IXM7 274 aa22.86■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 OR56B1Q8NGI3 324 aa22.86■■□□□ 1.25
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SEMA3B-215ENST00000621029 Q9H521 79 aa22.86■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 C12orf4Q9NQ89 552 aa22.86■■□□□ 1.25
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SEMA3B-215ENST00000621029 HSPA12AO43301 675 aa22.85■■□□□ 1.25
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SEMA3B-215ENST00000621029 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 MYL9P24844 172 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 TEX38Q6PEX7 206 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 Q6ZPA2 131 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 REC114Q7Z4M0 266 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 NABP2Q9BQ15 211 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF251Q9BRH9 671 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 ZFP57Q9NU63 452 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 NECAP2Q9NVZ3 263 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC23A1Q9UHI7 598 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 GABARAPL2P60520 117 aa22.84■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa22.84■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa22.84■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa22.84■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa22.84■■□□□ 1.25
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SEMA3B-215ENST00000621029 IFI27L2Q9H2X8 130 aa22.84■■□□□ 1.25
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SEMA3B-215ENST00000621029 VDAC1P21796 283 aa22.83■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM50BP56557 158 aa22.83■■□□□ 1.25
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SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 RAB22AQ9UL26 194 aa22.83■■□□□ 1.25
SEMA3B-215ENST00000621029 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-215ENST00000621029 RAB29O14966 203 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB25P24278 435 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-215ENST00000621029 CEACAM6P40199 344 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-215ENST00000621029 OR10A3P58181 314 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-215ENST00000621029 FOXB2Q5VYV0 432 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-215ENST00000621029 C18orf65Q6ZTR6 163 aa22.82■■□□□ 1.24
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