RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 HAAOP46952 286 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP1B3P54709 279 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PROK1P58294 105 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SEC61GP60059 68 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ACTA2P62736 377 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ACTG2P63267 376 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 IL18R1Q13478 541 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2V2Q15819 145 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR38Q5JTN6 314 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF691Q5VV52 312 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 USP43Q70EL4 1123 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CYGBQ8WWM9 190 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 FGGYQ96C11 551 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SEH1LQ96EE3 360 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 TECTBQ96PL2 329 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF649Q9BS31 505 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 HHLA2Q9UM44 414 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 NF1P21359 2839 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 OR2AT4A6NND4 320 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF879B4DU55 563 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 H0YJX3 145 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BSH0 61 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP6V0E1O15342 81 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PSG2P11465 335 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ATF1P18846 271 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PRKACBP22694 351 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 KIR3DL2P43630 455 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 GABRA2P47869 451 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 FHITP49789 147 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ARF6P62330 175 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 MED21Q13503 144 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 MKXQ8IYA7 352 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR148Q8TDV2 347 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 APH1BQ8WW43 257 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PP6455Q8WZ26 134 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 UPRTQ96BW1 309 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PELI1Q96FA3 418 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 BORCS8Q96FH0 119 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM80Q96HE8 168 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 VCXQ9H320 206 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CTSZQ9UBR2 303 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 J3QT63 122 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SIGLEC5O15389 551 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 NBR2O15453 112 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SYNGR1O43759 233 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 VENTXO95231 258 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CLIC3O95833 236 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 LIMS3P0CW19 117 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 LIMS4P0CW20 117 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PGA5P0DJD9 388 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 RBP2P50120 134 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CAV3P56539 151 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 FGF12P61328 243 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC58Q4VC31 144 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 STUMQ69YW2 141 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 UTS2BQ765I0 119 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 POC1AQ8NBT0 407 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms