RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 CCR7P32248 378 aa3.16□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.16□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.16□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 ANKRD7Q92527 254 aa3.16□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.16□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 MED28Q9H204 178 aa3.16□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.16□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.16□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 NACAE9PAV3 2078 aa3.15□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 SLIT3O75094 1523 aa3.15□□□□□ -1.9
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 COLCA2A8K830 154 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 K7EQS6 105 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 DEDDO75618 318 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 STK16O75716 305 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 FSTL3O95633 263 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 CGB3P0DN86 165 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 CGB7P0DN87 165 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 UCHL3P15374 230 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 TGFBR2P37173 567 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 SULT1A1P50225 295 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 NAA20P61599 178 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 HLA-DRB3P79483 266 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 AESQ08117 197 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 OR2F1Q13607 317 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 RSU1Q15404 277 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 Q8WTZ3 238 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 OTUB2Q96DC9 234 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 RMI2Q96E14 147 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 MED18Q9BUE0 208 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 TSSK6Q9BXA6 273 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 OR2D2Q9H210 308 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 OR51I2Q9H344 312 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 FIS1Q9Y3D6 152 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa3.15□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 A8MUU9 505 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 A8MWP4 228 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 KRT75O95678 551 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 IGLV3-27P01718 113 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 IGHG2P01859 326 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 TRGV3P03979 118 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 TCRBP04435 133 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF708P17019 499 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 CDK2P24941 298 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 CD34P28906 385 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 PMELP40967 661 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 SNAP25P60880 206 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 RAB5BP61020 215 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 OR10K2Q6IF99 312 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF709Q8N972 641 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 CDC26Q8NHZ8 85 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 OR51I1Q9H343 314 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 DNAJC12Q9UKB3 198 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 MIA3Q5JRA6 1907 aa3.14□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 DOCK8Q8NF50 2099 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 YEATS2Q9ULM3 1422 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 IGKV1D-33P01593 117 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 IGKV1-33P01594 117 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 TNNC2P02585 160 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 GABRA3P34903 492 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 HERVK_113P63121 156 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM78BQ5VT40 261 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 LINC00167Q96N53 147 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 PRAP1Q96NZ9 151 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 VPS29Q9UBQ0 182 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 UNC13AQ9UPW8 1703 aa3.13□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa3.12□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.12□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.12□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 EVPLLA8MZ36 301 aa3.12□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 MRASO14807 208 aa3.12□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 REG1AP05451 166 aa3.12□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 CD36P16671 472 aa3.12□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 ALOX5APP20292 161 aa3.12□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 OPRM1P35372 400 aa3.12□□□□□ -1.91
PIK3C3-211ENST00000589550 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms