RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584944.5

TRAF4-215, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-215ENST00000584944 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 YPEL1O60688 119 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 CRYBA1P05813 215 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 FCER2P06734 321 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 MELTFP08582 738 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 GSTT2P0CG29 244 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 GSTT2BP0CG30 244 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 LOXL3P58215 753 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 HILS1P60008 231 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 GNMTQ14749 295 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 MORN2Q502X0 79 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 LYG1Q8N1E2 194 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 OR4P4Q8NGL7 312 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 OR5R1Q8NH85 324 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 CYYR1Q96J86 154 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 YPEL2Q96QA6 119 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 SSX3Q99909 188 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 NECAP2Q9NVZ3 263 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 FABP12A6NFH5 140 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 OOSP1A8MZH6 123 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 HAX1O00165 279 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 SSX5O60225 188 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 TPPPO94811 219 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 DIRAS3O95661 229 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 PTHLHP12272 177 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 TAS2R46P59540 309 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 ACTBP60709 375 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 ACTG1P63261 375 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 IGSF11Q5DX21 431 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 Q6YL49 198 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 DUX5Q96PT3 197 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 S1PR3Q99500 378 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 POMT1Q9Y6A1 747 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 A3GALT2U3KPV4 340 aa11.24□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 DSCAML1Q8TD84 2053 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 H3BUX3 64 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 SULT1C2O00338 296 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 HSD17B6O14756 317 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 TXNL1O43396 289 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV1-47P01700 117 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 GPR12P47775 334 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 Q6ZS49 121 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 MOB3BQ86TA1 216 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 HOGA1Q86XE5 327 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 GHITMQ9H3K2 345 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 RDH8Q9NYR8 311 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 PIPOXQ9P0Z9 390 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 ZNRD1Q9P1U0 126 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.23□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 RAB29O14966 203 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 ST8SIA5O15466 376 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 RBBP9O75884 186 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 IGHV4-59P01825 116 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 HLA-DQB1P01920 261 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 FAM106CPP0CH98 169 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 TNFSF8P32971 234 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 RCVRNP35243 200 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 IER3P46695 156 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 HES1Q14469 280 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 AANATQ16613 207 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 CT45A1Q5HYN5 189 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 PYHIN1Q6K0P9 492 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 LDLRAD3Q86YD5 345 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00311Q8N616 119 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM86BQ8N661 226 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 CT45A3Q8NHU0 189 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 C17orf50Q8WW18 174 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 RAB18Q9NP72 206 aa11.22□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.21□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 IFNA6P05013 189 aa11.21□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 OR8U9P0C7N5 309 aa11.21□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 REG1BP48304 166 aa11.21□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 HERV-K104P61576 105 aa11.21□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 TSPAN5P62079 268 aa11.21□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 CDK10Q15131 360 aa11.21□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 SLC9A3R2Q15599 337 aa11.21□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 LY6EQ16553 131 aa11.21□□□□□ -0.61
TRAF4-215ENST00000584944 PYDC2Q56P42 97 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms