RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 TXNIPQ9H3M7 391 aa4□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 RBKSQ9H477 322 aa4□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 IKZF2Q9UKS7 526 aa4□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 F5H5P2 479 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 IFNA14P01570 189 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 OPN1SWP03999 348 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 HTR1FP30939 366 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 GGT2P36268 569 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 RPL14P50914 215 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 UGT2B15P54855 530 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 CAV3P56539 151 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 OR12D2P58182 307 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 ARL6IP1Q15041 203 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 RGNQ15493 299 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 C15orf32Q32M92 178 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 OR2T2Q6IF00 324 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 DNM1P34Q6PK57 102 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 LYPD2Q6UXB3 125 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 PGAP1Q75T13 922 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 OLIG3Q7RTU3 272 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 CALHM1Q8IU99 346 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 IFT20Q8IY31 132 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 OR56B4Q8NH76 319 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 GTSF1Q8WW33 167 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 STARD10Q9Y365 291 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 PLXNB1O43157 2135 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 H0YHG0 523 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRM-208ENST00000578600 APOC1P02654 83 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRM-208ENST00000578600 SERPINE1P05121 402 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRM-208ENST00000578600 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
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PTPRM-208ENST00000578600 SLC35B1P78383 322 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRM-208ENST00000578600 OR5AS1Q8N127 324 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRM-208ENST00000578600 KIR2DL4Q99706 377 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRM-208ENST00000578600 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRM-208ENST00000578600 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRM-208ENST00000578600 GGT3PA6NGU5 568 aa3.97□□□□□ -1.77
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PTPRM-208ENST00000578600 BIRC5O15392 142 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 GAS8-AS1O95177 125 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 GYPAP02724 150 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 RBP4P02753 201 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 ALDH3A1P30838 453 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 HOXC5Q00444 222 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 IL5RAQ01344 420 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 MAB21L1Q13394 359 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-208ENST00000578600 OXA1LQ15070 435 aa3.97□□□□□ -1.77
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