RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566613.1

GDPD3-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3, human

TSL 5

Gene GDPD3, Length 235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GDPD3-205	ENST00000566613	NUDT3	O95989	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	CELA3B	P08861	270 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	CCL2	P13500	99 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	DRD1	P21728	446 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	SRD5A2	P31213	254 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	DYNLT3	P51808	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	PIGP	P57054	158 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	RTP5	Q14D33	572 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	TBR1	Q16650	682 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF721	Q8TF20	911 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ARID1A	O14497	2285 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613		A0A1W2PR80	420 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	PDE6D	O43924	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF737	O75373	536 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	MPZL1	O95297	269 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	CA2	P00918	260 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	TNF	P01375	233 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	CLEC3B	P05452	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	F2R	P25116	425 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ARL3	P36405	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	PLP1	P60201	277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	RUNX1	Q01196	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	DUSP2	Q05923	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	MEP1B	Q16820	701 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	LTC4S	Q16873	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	WBP2	Q969T9	261 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GDPD3-205	ENST00000566613	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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