RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566376.3

TCF4-233, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 462 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-233	ENST00000566376	CCDC107	Q8WV48	283 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	FAM46B	Q96A09	425 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	RITA1	Q96K30	269 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	GPER1	Q99527	375 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	C8orf4	Q9NR00	106 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	RYR2	Q92736	4967 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	IRGM	A1A4Y4	181 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	LEUTX	A8MZ59	168 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	MYL12B	O14950	172 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	LDLRAD4	O15165	306 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	SLC22A1	O15245	554 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	PROP1	O75360	226 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	NAPSA	O96009	420 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	IGKV1D-33	P01593	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	IGKV1-33	P01594	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	CRHBP	P24387	322 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	CNTFR	P26992	372 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	HTR2C	P28335	458 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	TMEM50B	P56557	158 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	BLOC1S1	P78537	153 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	NDP	Q00604	133 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	HMGN3	Q15651	99 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	AWAT2	Q6E213	333 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	OR52W1	Q6IF63	320 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	RAB12	Q6IQ22	244 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	LINC00596	Q86U02	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	IL17D	Q8TAD2	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	MYDGF	Q969H8	173 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	TOMM40L	Q969M1	308 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	PHF21A	Q96BD5	680 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	TMED9	Q9BVK6	235 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	TM2D1	Q9BX74	207 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	METTL9	Q9H1A3	318 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	RAB18	Q9NP72	206 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	ING4	Q9UNL4	249 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF785	A8K8V0	405 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	OOSP1	A8MZH6	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	AIP	O00170	330 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	SOCS1	O15524	211 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	ORC5	O43913	435 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	PDCD6	O75340	191 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	IGHG2	P01859	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	HBZ	P02008	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	GTF2F2	P13984	249 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	F2RL1	P55085	397 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	CLDN12	P56749	244 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	LINC00205	P59089	165 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	TAS2R43	P59537	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	KRTAP10-11	P60412	298 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	PPP3R1	P63098	170 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	FABP5	Q01469	135 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	FOXE3	Q13461	319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	TPBG	Q13641	420 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	SPHAR	Q15513	63 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376		Q6ZTK2	550 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF329	Q86UD4	541 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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