RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	RFX2	P48378	723 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	HERV-K104	P61576	105 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	MIDN	Q504T8	468 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF626	Q68DY1	528 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	MMP28	Q9H239	520 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	MCUB	Q9NWR8	336 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	NUP50	Q9UKX7	468 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ABCD4-223	ENST00000555904	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1W2PRD5	423 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1W2PRF3	423 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1W2PRM7	423 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ITGB1BP1	O14713	200 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	LANCL1	O43813	399 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	AVP	P01185	164 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	AMY2A	P04746	511 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	HTR1D	P28221	377 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ARHGDIB	P52566	201 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	BAK1	Q16611	211 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	BEX2	Q9BXY8	128 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	GHITM	Q9H3K2	345 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF221	Q9UK13	617 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	AKAP9	Q99996	3911 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1W2PPE3	182 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ODF3B	A8MYP8	253 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	LEUTX	A8MZ59	168 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904		J3QRK9	145 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	PPY	P01298	95 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	CD74	P04233	296 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	OR8U9	P0C7N5	309 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	EPHA1	P21709	976 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SAA4	P35542	130 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	FXYD4	P59646	89 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	HCP5	Q6MZN7	132 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	C16orf87	Q6PH81	154 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	LYG1	Q8N1E2	194 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	LINC00311	Q8N616	119 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	BORCS5	Q969J3	196 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	PRRT1	Q99946	306 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	RAB29	O14966	203 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	ST8SIA5	O15466	376 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	UPK1B	O75841	260 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC22A5	O76082	557 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	IGLV1-47	P01700	117 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	AADAC	P22760	399 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR12	P47775	334 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	OR56B4	Q8NH76	319 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	TOMM40L	Q969M1	308 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	RPE	Q96AT9	228 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	S1PR3	Q99500	378 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ABCD4-223	ENST00000555904	OR2D2	Q9H210	308 aa		10.18	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms