RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	RAB39B	Q96DA2	213 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	TVP23C	Q96ET8	276 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997		A0A087X0M5	115 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997		A0A1B0GX30	115 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	HSD17B6	O14756	317 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	XRCC2	O43543	280 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	RD3L	P0DJH9	198 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	CHRNB4	P30926	498 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	UBE2K	P61086	200 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997		Q8WTZ3	238 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	CYYR1	Q96J86	154 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	PECR	Q9BY49	303 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	ROS1	P08922	2347 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	C16orf97	H3BN30	126 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	NRAS	P01111	189 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	RNF224	P0DH78	156 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	DUSP1	P28562	367 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	OR8B8	Q15620	311 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	LURAP1	Q96LR2	239 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	HCFC1	P51610	2035 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM187	Q14656	261 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	SSX3	Q99909	188 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	DVL1	O14640	695 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	ASCL1	P50553	236 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF83	P51522	516 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	RND2	P52198	227 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	GAMT	Q14353	236 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		13.96	□□□□□ -0.17
BRF1-208	ENST00000546997	SMPD2	O60906	423 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	C1QL1	O75973	258 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	SOD3	P08294	240 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	CXCL1	P09341	107 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	FHIT	P49789	147 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	HSPA12A	O43301	675 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	HBE1	P02100	147 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	ERVS71-1	P61550	626 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	DLK1	P80370	383 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF843	Q8N446	348 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	RHOV	Q96L33	236 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	NEU1	Q99519	415 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997		M0R1B8	84 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	PITX3	O75364	302 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	FGF7	P21781	194 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	FUT6	P51993	359 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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