RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 NRG4Q8WWG1 115 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 PHYHIPQ92561 330 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 NICN1Q9BSH3 213 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 KLK15Q9H2R5 256 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNK15Q9H427 330 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 SCOCQ9UIL1 159 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 JPT1Q9UK76 154 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.22□□□□□ -0.93
CLSTN3-211ENST00000541667 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 NUDT19A8MXV4 375 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 PTGES3LE9PB15 166 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC22A1O15245 554 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 PROP1O75360 226 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 UCHL1P09936 223 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 FHL3Q13643 280 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 SPHARQ15513 63 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 KCTD7Q96MP8 289 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 TMED9Q9BVK6 235 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 GON7Q9BXV9 100 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 IFI27L2Q9H2X8 130 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 DUSP21Q9H596 190 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB9BQ9NP90 201 aa9.21□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 G3V318 75 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV1-40P01703 118 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 UBBP0CG47 229 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM50BP56557 158 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 ACTBP60709 375 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 SVOPQ8N4V2 548 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 NPBQ8NG41 125 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 THRSPQ92748 146 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 B9D2Q9BPU9 175 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 AGMATQ9BSE5 352 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 MND1Q9BWT6 205 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 CST11Q9H112 138 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRC42Q9Y546 428 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.2□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 I3L521 148 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 SOCS1O15524 211 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFA3O95167 84 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 HLA-DRB1P01911 266 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 CT45A6P0DMU7 189 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 CT45A5P0DMU8 189 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 CT45A7P0DMV0 189 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 TPBGQ13641 420 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 GLT8D1Q68CQ7 371 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNG3Q8TAE7 436 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 GALMQ96C23 342 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 OR51J1Q9H342 316 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 GNB4Q9HAV0 340 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.19□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 FCN1O00602 326 aa9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP6V0E1O15342 81 aa9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 ST8SIA5O15466 376 aa9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 SOX15O60248 233 aa9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 VDAC1P21796 283 aa9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 MYF6P23409 242 aa9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 NDPQ00604 133 aa9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 RUNX1Q01196 453 aa9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 MMDQ15546 238 aa9.18□□□□□ -0.94
CLSTN3-211ENST00000541667 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms