RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540475.5

SEMA4D-223, Transcript of semaphorin 4D, human

TSL 3

Gene SEMA4D, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA4D-223	ENST00000540475	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SEMA4D-223	ENST00000540475	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	PTGES3L	E9PB15	166 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	ITGB1BP1	O14713	200 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	BPNT1	O95861	308 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	MPIG6B	O95866	241 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	PSMB8	P28062	276 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	SOX6	P35712	828 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	GNMT	Q14749	295 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	NPB	Q8NG41	125 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	NRG4	Q8WWG1	115 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	GALM	Q96C23	342 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RAX2	Q96IS3	184 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	NABP2	Q9BQ15	211 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	TMED9	Q9BVK6	235 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475		A0A0A6YYD4	124 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	CCL24	O00175	119 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RGS11	O94810	467 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	MYF6	P23409	242 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	MED22	Q15528	200 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	TRAM1	Q15629	374 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	SVOP	Q8N4V2	548 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RITA1	Q96K30	269 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	GFI1	Q99684	422 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	GHITM	Q9H3K2	345 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	HSF4	Q9ULV5	492 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	NDUFA3	O95167	84 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	HLA-DRB1	P01911	266 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR5H8	P0DN80	308 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	CPE	P16870	476 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	AQP4	P55087	323 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	FHL3	Q13643	280 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	UFD1	Q92890	307 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	NUDT19	A8MXV4	375 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	SLC17A2	O00624	439 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	IGLV1-40	P01703	118 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR3A3	P47888	321 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	TMEM50B	P56557	158 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	ACTB	P60709	375 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	DPF1	Q92782	380 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	KCTD7	Q96MP8	289 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RAB29	O14966	203 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	LDLRAD4	O15165	306 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	SOCS1	O15524	211 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RGS10	O43665	173 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	VDAC1	P21796	283 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	CRHBP	P24387	322 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	RUNX1	Q01196	453 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	MMD	Q15546	238 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SEMA4D-223	ENST00000540475	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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