RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 C6orf183Q5T699 404 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 LIN54Q6MZP7 749 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ACSM6Q6P461 480 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 LYPD6Q86Y78 171 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SYS1Q8N2H4 156 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR52N1Q8NH53 320 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR5AK2Q8NH90 309 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 NEK7Q8TDX7 302 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 C4orf36Q96KX1 117 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CIB1Q99828 191 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF251Q9BRH9 671 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CST11Q9H112 138 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 KLK15Q9H2R5 256 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ING4Q9UNL4 249 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 MCRIP1C9JLW8 97 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 AIPO00170 330 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 JTBO76095 146 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 MT-ND4P03905 459 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 IFNA6P05013 189 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CD2P06729 351 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CD40LGP29965 261 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 VHLP40337 213 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GNB1P62873 340 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 PITPNAQ00169 270 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 MMDQ15546 238 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 PIGYQ3MUY2 71 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 PYHIN1Q6K0P9 492 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF529Q6P280 563 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR10K1Q8NGX5 313 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC107Q8WV48 283 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR5B12Q96R08 314 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 KIAA1456Q9P272 454 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GNG12Q9UBI6 72 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 RNF150Q9ULK6 438 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.91□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 G3V318 75 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ATP6V0E1O15342 81 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 NBR2O15453 112 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 HSPA12AO43301 675 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CA11O75493 328 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GTF2F2P13984 249 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ACTBP60709 375 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF554Q86TJ5 538 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 NPBQ8NG41 125 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR51A2Q8NGJ7 313 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ALG8Q9BVK2 526 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TOLLIPQ9H0E2 274 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 PARP11Q9NR21 331 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 STUB1Q9UNE7 303 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 LRRC42Q9Y546 428 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 AP4S1Q9Y587 144 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ORC6Q9Y5N6 252 aa5.9□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms