RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, human

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1B-208	ENST00000515588	LYG1	Q8N1E2	194 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588		Q8N6K4	173 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	MMP27	Q9H306	513 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	RAB27B	O00194	218 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	LANCL1	O43813	399 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	FBXO24	O75426	580 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	RAB6A	P20340	208 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CD1B	P29016	333 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	RANBP1	P43487	201 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588		Q9N2K0	584 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	SSR3	Q9UNL2	185 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	NOTO	A8MTQ0	251 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	PEX14	O75381	377 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CSF1	P09603	554 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	SCT	P09683	121 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	GADD45A	P24522	165 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	OR3A3	P47888	321 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	RAB3C	Q96E17	227 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	MFNG	O00587	321 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	ST8SIA5	O15466	376 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	FGF16	O43320	207 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	TXNL1	O43396	289 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	RGS11	O94810	467 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	GNB3	P16520	340 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CD36	P16671	472 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	SDC2	P34741	201 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	HLA-DRB3	P79483	266 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	TPRA1	Q86W33	373 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	PTX4	Q96A99	478 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	KCTD7	Q96MP8	289 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CENPO	Q9BU64	300 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	MOS	P00540	346 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CD83	Q01151	205 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	LSAMP	Q13449	338 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588		Q8N9W7	124 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	NABP2	Q9BQ15	211 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588		A0A075B6Q4	140 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	LINC01548	A6NM66	108 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	TRDC	B7Z8K6	153 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CD3G	P09693	182 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	CEACAM6	P40199	344 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	F2RL1	P55085	397 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	MXD1	Q05195	221 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	RITA1	Q96K30	269 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SERF1B-208	ENST00000515588	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SERF1B-208	ENST00000515588	ITGB1BP1	O14713	200 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SERF1B-208	ENST00000515588	TNFAIP8	O95379	198 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SERF1B-208	ENST00000515588	IGHG2	P01859	326 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SERF1B-208	ENST00000515588	FCGR3A	P08637	254 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SERF1B-208	ENST00000515588	ZBTB25	P24278	435 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SERF1B-208	ENST00000515588	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		12.45	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms