RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB9B	Q9NP90	201 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	AK3	Q9UIJ7	227 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	LSAMP	Q13449	338 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPART	Q8N0X7	666 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	GALM	Q96C23	342 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	RITA1	Q96K30	269 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR4F4	Q96R69	305 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	S1PR3	Q99500	378 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	NABP2	Q9BQ15	211 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABCG5	Q9H222	651 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSF4	Q9ULV5	492 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014		V9GY05	133 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMB11	A5LHX3	300 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXNL1	O43396	289 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOS	P00540	346 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR12	P47775	334 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR3A3	P47888	321 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	VEGFC	P49767	419 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	HES5	Q5TA89	166 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	PECR	Q9BY49	303 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0B4J203	849 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST8SIA5	O15466	376 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFHR3	Q02985	330 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	STPG2	Q8N412	459 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q9N2K0	584 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC42	Q9Y546	428 aa		10	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFITM5	A6NNB3	132 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPINE3	A8MV23	424 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	PROP1	O75360	226 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCT	P09683	121 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAL	P22466	123 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNTFR	P26992	372 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMD7	P51665	324 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	HLA-DRB3	P79483	266 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	C22orf42	Q6IC83	251 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB27B	O00194	218 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGB1BP1	O14713	200 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	RGS11	O94810	467 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	CT45A6	P0DMU7	189 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	CT45A5	P0DMU8	189 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	CT45A7	P0DMV0	189 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	SETD6	Q8TBK2	473 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHF21A	Q96BD5	680 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SH3BP2-222	ENST00000512014	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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