RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506401.6

ITGA3-207, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 1,817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-207ENST00000506401 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 NAA60Q9H7X0 242 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 MPPED1O15442 326 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 SLC22A5O76082 557 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 SSTR2P30874 369 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 ATP5J2P56134 94 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 BVESQ8NE79 360 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 A0A0B4J2A0 478 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 CXCL3P19876 107 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 NFYBP25208 207 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 GNB2P62879 340 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 CD300CQ08708 224 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF787Q6DD87 383 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 A0A1W2PPH5 198 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 CCL3L1P16619 93 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 KCTD9Q7L273 389 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 RAB39BQ96DA2 213 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 GALNT14Q96FL9 552 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 OR2D2Q9H210 308 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 RNF150Q9ULK6 438 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 ARID1AO14497 2285 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA3-207ENST00000506401 GOSR2O14653 212 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ITGB1BP1O14713 200 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ESCO2Q56NI9 601 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 LIN54Q6MZP7 749 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PSG11Q9UQ72 335 aa14.71□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 TENM4Q6N022 2769 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 RAB7AP51149 207 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 MSMO1Q15800 293 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 DRAM1Q8N682 238 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 FAM168AQ92567 244 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 SPG11Q96JI7 2443 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 OR5AC1P0C628 307 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PAX1P15863 534 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 NDUFS8O00217 210 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ST8SIA5O15466 376 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 TNFSF12O43508 249 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 MMP23AO75900 390 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 IGLV2-14P01704 120 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 DLX6P56179 175 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM187Q14656 261 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 SP6Q3SY56 376 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 NRGNQ92686 78 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 AGMATQ9BSE5 352 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 DBX1A6NMT0 343 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 RNF212BA8MTL3 300 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 B3GALNT1O75752 331 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 IGHV3-7P01780 117 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 IGHV2-5P01817 119 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 GPR12P47775 334 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 LEAP2Q969E1 77 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 MARVELD3Q96A59 401 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PERPQ96FX8 193 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 GSX2Q9BZM3 304 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PRR13Q9NZ81 148 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 LIPFP07098 398 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 HLA-GP17693 338 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms