RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 PRNDQ9UKY0 176 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SCML2Q9UQR0 700 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ASF1AQ9Y294 204 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 V9GYH0 126 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A0B4J2A0 478 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 B4DEV8 164 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 PRSS46E5RG02 174 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 NME4O00746 187 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 OR2H2O95918 312 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 IGLC1P0CG04 106 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 CD1DP15813 335 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TFPI2P48307 235 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 INPP1P49441 399 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HBMQ6B0K9 141 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 OR2T2Q6IF00 324 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM166AQ6J272 317 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6ZVL8 140 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 CDC20BQ86Y33 519 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 STPG4Q8N801 248 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 IMMP2LQ96T52 175 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ASIC5Q9NY37 505 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 LAMA1P25391 3075 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SPAG17Q6Q759 2223 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 A6NDN8 102 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 GGT3PA6NGU5 568 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SULT2B1O00204 365 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 CTSEP14091 401 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 CREB1P16220 341 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 PGCP20142 388 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TNFSF8P32971 234 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 CXCL12P48061 93 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 GZMMP51124 257 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 HGFACQ04756 655 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FHL3Q13643 280 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF74Q16587 644 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FBXL22Q6P050 247 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6ZSR3 168 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 OR4L1Q8NH43 312 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM168AQ92567 244 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 UPRTQ96BW1 309 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXB1Q99853 325 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 CHIAQ9BZP6 476 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 COMMD9Q9P000 198 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM186AA6NE01 2351 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 NUP205Q92621 2012 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TSPAN11A1L157 253 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 LMO7DNF2Z398 122 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 LDB3O75112 727 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 CRLF1O75462 422 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SCTP09683 121 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 H2BFMP0C1H6 154 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 IDSP22304 550 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 PGGT1BP53609 377 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 TPPP2P59282 170 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF345Q14585 488 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-214ENST00000497648 GUSBP1Q15486 140 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms