RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 MOB3BQ86TA1 216 aa14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 LYG1Q8N1E2 194 aa14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 Q8N2B8 174 aa14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRDCB7Z8K6 153 aa14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 FCGR3AP08637 254 aa14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 BLCAPP62952 87 aa14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDNFQ49AH0 187 aa14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 DTX3Q8N9I9 347 aa14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ETV7Q9Y603 341 aa14.27□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM127O75204 238 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SCGNO76038 276 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARFRP1Q13795 201 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 HES1Q14469 280 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARL6IP1Q15041 203 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 Q6ZS46 218 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 CITED1Q99966 193 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 TXNL1O43396 289 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 LANCL1O43813 399 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGKV1D-33P01593 117 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGKV1-33P01594 117 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 LPLP06858 475 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM11P17152 192 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZBTB25P24278 435 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 NCS1P62166 190 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 C11orf88Q6PI97 169 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPATA2Q9UM82 520 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ST8SIA5O15466 376 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 FABP7O15540 132 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 HSPA12AO43301 675 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 CD1BP29016 333 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 TALDO1P37837 337 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 CEACAM6P40199 344 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SERPINB10P48595 397 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 VBP1P61758 197 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 EBI3Q14213 229 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 HNF4GQ14541 408 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 HERPUD1Q15011 391 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 HACD4Q5VWC8 232 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ITGB1BP1O14713 200 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 AMY1AP04745 511 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 AMY2AP04746 511 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 GSTT2P0CG29 244 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 GSTT2BP0CG30 244 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR3A3P47888 321 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIR2DS1Q14954 304 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 PHF21AQ96BD5 680 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM235A6NFC5 223 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 M0QZK8 103 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 TFAP2AP05549 437 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 DTYMKP23919 212 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ALDH3B2P48448 385 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGSF11Q5DX21 431 aa14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.3 ms