RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 DBX1A6NMT0 343 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 F2RL2O00254 374 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFB3O43676 98 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV2-70P01814 119 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LYNX1P0DP58 116 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFB7P17568 137 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 S100GP29377 79 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 SSTR5P35346 364 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RAP2BP61225 183 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LIN54Q6MZP7 749 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 KCTD9Q7L273 389 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 NOXA1Q86UR1 476 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 MBD6Q96DN6 1003 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CALYQ9NYX4 217 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.89□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 hADV38S2A0JD32 116 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 HSD17B6O14756 317 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 MPPED1O15442 326 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 SIX6O95475 246 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 DAOP14920 347 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM187Q14656 261 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 MSMO1Q15800 293 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 BVESQ8NE79 360 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RFESDQ8TAC1 157 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB1CQ92928 201 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TIMD4Q96H15 378 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 C18orf12Q96KH6 178 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CHIAQ9BZP6 476 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB18Q9NP72 206 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 JPT1Q9UK76 154 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 VPS13CQ709C8 3753 aa8.88□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 SMLR1H3BR10 107 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 DVL1O14640 695 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 YPEL1O60688 119 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RGS11O94810 467 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 WNT2P09544 360 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR5AC1P0C628 307 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 GZMKP49863 264 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 H2BFSP57053 126 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 GNMTQ14749 295 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 DCAF12L2Q5VW00 463 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TCF23Q7RTU1 214 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 FGFRL1Q8N441 504 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LRTM2Q8N967 370 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 HYLS1Q96M11 299 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 YPEL2Q96QA6 119 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 MDFIQ99750 246 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 SMR3AQ99954 134 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CHODLQ9H9P2 273 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CTSZQ9UBR2 303 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CLN8Q9UBY8 286 aa8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OVOL3O00110 214 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 ITGB1BP1O14713 200 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 FCN3O75636 299 aa8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms