RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 NDUFA2O43678 99 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 SNAPC5O75971 98 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 SOD3P08294 240 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 C4BPBP20851 252 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 COL8A2P25067 703 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 F2RP25116 425 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 PSMB6P28072 239 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 SSTR2P30874 369 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 CR1LQ2VPA4 569 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF546Q86UE3 836 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF843Q8N446 348 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 OR10C1Q96KK4 312 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 COL12A1Q99715 3063 aa7.31□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 H0Y980 276 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 SERPINE2P07093 398 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 FGFRL1Q8N441 504 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 DRAM1Q8N682 238 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 SLC35G3Q8N808 338 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 LRTM2Q8N967 370 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 CLN8Q9UBY8 286 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 JPT1Q9UK76 154 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 PSG11Q9UQ72 335 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 A6NNC1 897 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 RNF212BA8MTL3 300 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 HMSDA8MTL9 139 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 MPC2O95563 127 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 IGHV3-7P01780 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 DANCRP0C864 163 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 PET100P0DJ07 73 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 NFYBP25208 207 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 S100A10P60903 97 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 MFFQ9GZY8 342 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.3□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 DVL1O14640 695 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 ST8SIA5O15466 376 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 YPEL1O60688 119 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 B3GALNT1O75752 331 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 LY6HO94772 140 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 SCGB1D2O95969 90 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 IGLV2-14P01704 120 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 IGFBP2P18065 325 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 MORN2Q502X0 79 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 TIMD4Q96H15 378 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 C18orf12Q96KH6 178 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 YPEL2Q96QA6 119 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 GON7Q9BXV9 100 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 A0A1W2PPR1 153 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 F2RL2O00254 374 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 CDS2O95674 445 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 DAOP14920 347 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 CXCL2P19875 107 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 UCP1P25874 307 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 GPR12P47775 334 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 IFITM2Q01629 132 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 CATR1Q13166 79 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 RAB32Q13637 225 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 SMCO1Q147U7 214 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 AVPI1Q5T686 147 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 DTX2Q86UW9 622 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 DCUN1D4Q92564 292 aa7.29□□□□□ -1.24
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM56Q96MV1 263 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms