RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SLC30A7Q8NEW0 376 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 NRIP2Q9BQI9 281 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 FGF7P21781 194 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 R3HDM4Q96D70 268 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 NAA60Q9H7X0 242 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 RHOFQ9HBH0 211 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 IL36GQ9NZH8 169 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 A8MXE2 369 aa5.95□□□□□ -1.46
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HERC4-211ENST00000492996 LINC00614P0C842 121 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 GNLYP22749 145 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ASCL1P50553 236 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CBLN4Q9NTU7 201 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.95□□□□□ -1.46
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HERC4-211ENST00000492996 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TNFSF12O43508 249 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CGAP01215 116 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 PPYP01298 95 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 S100A7AQ86SG5 101 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 RNF141Q8WVD5 230 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TECTBQ96PL2 329 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OR2J1Q9GZK6 312 aa5.94□□□□□ -1.46
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HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPE2 198 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OR5H1A6NKK0 313 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 A8MWP6 167 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 K7EPK0 472 aa5.94□□□□□ -1.46
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HERC4-211ENST00000492996 TMEM187Q14656 261 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 KHDC3LQ587J8 217 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 AWAT1Q58HT5 328 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SSX7Q7RTT5 188 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OR52M1Q8NGK5 317 aa5.94□□□□□ -1.46
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HERC4-211ENST00000492996 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TP53RKQ96S44 253 aa5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPQ1 181 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 HSD17B6O14756 317 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TK1P04183 234 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 HKR1P10072 659 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.93□□□□□ -1.46
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HERC4-211ENST00000492996 OR5P3Q8WZ94 311 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 MOB3AQ96BX8 217 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 FBXL17Q9UF56 701 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.93□□□□□ -1.46
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HERC4-211ENST00000492996 GRPP07492 148 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TMEM33P57088 247 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 GNG3P63215 75 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 NCR3LG1Q68D85 454 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.93□□□□□ -1.46
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