RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	MED20	Q9H944	212 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813		H0YJX3	145 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ARPC2	O15144	300 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SPINT2	O43291	252 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SPRY2	O43597	315 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TSC22D2	O75157	780 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	MT-ND2	P03891	347 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SEMG1	P04279	462 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	KRT8	P05787	483 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CSN3	P07498	182 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	COX4I1	P13073	169 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ATF1	P18846	271 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PLGLA	Q15195	96 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	LTC4S	Q16873	150 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	RNF5	Q99942	180 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813		A0A1W2PPE3	182 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813		A6NIN4	97 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SOX15	O60248	233 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CCDC22	O60826	627 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	RBBP9	O75884	186 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ACTL6B	O94805	426 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SOX14	O95416	240 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CLEC3B	P05452	202 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CD7	P09564	240 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	MC5R	P33032	325 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SSTR5	P35346	364 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	VHL	P40337	213 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CXCR4	P61073	352 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PSME3	P61289	254 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CX3CL1	P78423	397 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	POC5	Q8NA72	575 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	THRSP	Q92748	146 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	REEP1	Q9H902	201 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.22	□□□□□ -1.73

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