RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO24	O75426	580 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN15	O95858	294 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NAPSA	O96009	420 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	LPL	P06858	475 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GNB3	P16520	340 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	IL3RA	P26951	378 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX6	P35712	828 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TGFBR1	P36897	503 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GDNF	P39905	211 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB7A	P51149	207 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TMBIM6	P55061	237 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA1A	Q53H76	456 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8H3	Q8N146	312 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NOTCH1	P46531	2555 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM172BP	A6NC97	362 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB27B	O00194	218 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	BLCAP	P62952	87 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HTD2	P86397	168 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CTF1	Q16619	201 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RPE	Q96AT9	228 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4F4	Q96R69	305 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GNG10	P50151	68 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1L1	Q8NH94	360 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MFNG	O00587	321 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA12A	O43301	675 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF16	O43320	207 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GNG2	P59768	71 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CD83	Q01151	205 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	EBI3	Q14213	229 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGN3	Q15651	99 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	UBALD1	Q8TB05	177 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CMTM3	Q96MX0	182 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424		Q9N2K0	584 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-7	P01780	117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB25	P24278	435 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	LEAP2	Q969E1	77 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	YPEL1	O60688	119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	DTYMK	P23919	212 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	LOXL3	P58215	753 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PPI3	338 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNL1	O43396	289 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	XRCC3	O43542	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	AMY1A	P04745	511 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	AMY2A	P04746	511 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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