RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	BMP5	P22003	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SELENOV	P59797	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	HTD2	P86397	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXE3	Q13461	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LRP11	Q86VZ4	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RND1	Q92730	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	COQ2	Q96H96	371 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LAMA5	O15230	3695 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ACACA	Q13085	2346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SIRPB1	O00241	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TAAR5	O14804	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MGST3	O14880	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	WNT9B	O14905	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PITX3	O75364	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	DEDD	O75618	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FSTL3	O95633	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	NMB	P08949	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	HOXB5	P09067	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RRAS	P10301	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PSG2	P11465	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SFTPC	P11686	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP9	P14780	707 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	EGR1	P18146	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	F2R	P25116	425 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	S100G	P29377	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PRDX2	P32119	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ASCL1	P50553	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FXYD4	P59646	89 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	EFNB3	Q15768	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149 ms