RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 MYCNOSP40205 109 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 AQP4P55087 323 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ACTBP60709 375 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 LSAMPQ13449 338 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ECSCRQ19T08 205 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CDH26Q8IXH8 852 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RAX2Q96IS3 184 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CLCC1Q96S66 551 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RNF150Q9ULK6 438 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ERICH4A6NGS2 130 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 G3V318 75 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RGS10O43665 173 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 LANCL1O43813 399 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CA11O75493 328 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 GLAP06280 429 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ARSBP15848 533 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CHATP28329 748 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CEACAM6P40199 344 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ECI1P42126 302 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 MAP2K4P45985 399 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 VEGFCP49767 419 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CLDN12P56749 244 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 DGCR2P98153 550 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 EBI3Q14213 229 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RAB11BQ15907 218 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 HES5Q5TA89 166 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 Q8N6K4 173 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 OR8U1Q8NH10 309 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RITA1Q96K30 269 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 KCTD7Q96MP8 289 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 GHRLQ9UBU3 117 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 JPT1Q9UK76 154 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V0E1O15342 81 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 NBR2O15453 112 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 SOCS1O15524 211 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 SC5DO75845 299 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 CD1AP06126 327 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 UNC119Q13432 240 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 FOXE3Q13461 319 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 Q3ZCU0 254 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 LIN54Q6MZP7 749 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 OR11H1Q8NG94 326 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 PHYHIPQ92561 330 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 CNBD2Q96M20 576 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 PRR25Q96S07 402 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 NABP2Q9BQ15 211 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 FBXL15Q9H469 300 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 AK3Q9UIJ7 227 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC42Q9Y546 428 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0A6YYD4 124 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PN81 502 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 YPEL1O60688 119 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 ARL6IP5O75915 188 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 BPNT1O95861 308 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 ELANEP08246 267 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 CD3GP09693 182 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-209ENST00000480420 UCHL1P09936 223 aa6.32□□□□□ -1.4
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