RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472420.5

LRPPRC-208, Transcript of leucine rich pentatricopeptide repeat containing, human

TSL 2

Gene LRPPRC, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRPPRC-208	ENST00000472420	GHSR	Q92847	366 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC22A1	O15245	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	DHRS3	O75911	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	IDO1	P14902	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	EPHA2	P29317	976 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	RHOG	P84095	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SCN1B	Q07699	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	MREG	Q8N565	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	AMELY	Q99218	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	GPR84	Q9NQS5	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF134	P52741	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CRISP1	P54107	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420		Q6P435	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CCDC22	O60826	627 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CYB5A	P00167	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	REG1A	P05451	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ABHD2	P08910	425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	MYOD1	P15172	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	OXA1L	Q15070	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420		Q6ZSA8	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	TEAD3	Q99594	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	HSPB6	O14558	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	DEGS1	O15121	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ITM2A	O43736	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	NUDT3	O95989	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	KRT4	P19013	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	GZMH	P20718	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	GAL	P22466	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ARL3	P36405	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	PAX5	Q02548	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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