RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 PTX4Q96A99 478 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RAB3CQ96E17 227 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 KCTD7Q96MP8 289 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.29□□□□□ -1.24
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SYN3-211ENST00000472027 Q9N2K0 584 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.29□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RAB27BO00194 218 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TXNL1O43396 289 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 LANCL1O43813 399 aa7.28□□□□□ -1.24
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SYN3-211ENST00000472027 CD28P10747 220 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CEACAM6P40199 344 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HLA-DRB3P79483 266 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 MXD1Q05195 221 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CENPOQ9BU64 300 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 STAB1Q9NY15 2570 aa7.28□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 A0A075B6Q4 140 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TRDCB7Z8K6 153 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 MFNGO00587 321 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ST8SIA5O15466 376 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 FGF16O43320 207 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 FBXO24O75426 580 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TSPAN15O95858 294 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 MOSP00540 346 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CSF1P09603 554 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CD3GP09693 182 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ZBTB25P24278 435 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 Q8N6K4 173 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 YIPF6Q96EC8 236 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 NABP2Q9BQ15 211 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 MMP27Q9H306 513 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.27□□□□□ -1.25
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SYN3-211ENST00000472027 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.27□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SERPINE3A8MV23 424 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ITGB1BP1O14713 200 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 RAB29O14966 203 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 HSPA12AO43301 675 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 FCGR3AP08637 254 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 GSTT2P0CG29 244 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 GSTT2BP0CG30 244 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TGFBR1P36897 503 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR3A3P47888 321 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 F2RL1P55085 397 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 LSAMPQ13449 338 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ARFRP1Q13795 201 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CDNFQ49AH0 187 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 IDNKQ5T6J7 187 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 Q8N9W7 124 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 GHITMQ9H3K2 345 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 LINC01548A6NM66 108 aa7.25□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 FABP7O15540 132 aa7.25□□□□□ -1.25
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