RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464025.5

LMO2-204, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMO2, Length 1,550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-204ENST00000464025 TAS2R30P59541 319 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 Q6ZRM9 215 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 DOLPP1Q86YN1 238 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 NINJ1Q92982 152 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 DUSP13Q9UII6 198 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 METRNQ9UJH8 293 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 UMAD1C9J7I0 102 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 EGR1P18146 543 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ADCYAP1P18509 176 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 GZMHP20718 246 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 DEFA5Q01523 94 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ZNF273Q14593 569 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 NUP37Q8NFH4 326 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 CADP27708 2225 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 MGST3O14880 152 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 SPINT2O43291 252 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 TXNL1O43396 289 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 GLIPR1P48060 266 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 CATR1Q13166 79 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 Q8NA96 180 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 UBALD1Q8TB05 177 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 FAM222BQ8WU58 562 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 OR2V2Q96R30 315 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 TREM1Q9NP99 234 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 CACNG5Q9UF02 275 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 K7N7A8 449 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 TOR1AO14656 332 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 SYNGR2O43760 224 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 DYNLT3P51808 116 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 AKR1C2P52895 323 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 SELENOVP59797 346 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 FAM27E3Q08E93 113 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 OR2D2Q9H210 308 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 F8W036 122 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 K7ENP7 123 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 DFFBO76075 338 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 P0C879 139 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 EPHA1P21709 976 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 CD40P25942 277 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ATP6V0CP27449 155 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 SNCAP37840 140 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 SULT1A1P50225 295 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 AKR1C1Q04828 323 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 STX12Q86Y82 276 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 FGFRL1Q8N441 504 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 LFNGQ8NES3 379 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 C5orf30Q96GV9 206 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ATP5SQ99766 215 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 JKAMPQ9P055 326 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 IL19Q9UHD0 177 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 USF3Q68DE3 2245 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 A0A0G2JNJ9 132 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 A0A1B0GW64 132 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ODAMA1E959 279 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 FAM157AC9JC47 383 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 TSPAN15O95858 294 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 CAMLGP49069 296 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 TBR1Q16650 682 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 SCRT1Q9BWW7 348 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 Q9UFV3 132 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 JPT1Q9UK76 154 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO2-204ENST00000464025 PTAFRP25105 342 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 CCKARP32238 428 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO2-204ENST00000464025 CLINT1Q14677 625 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms