RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 TENM2Q9NT68 2774 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 LINC01619G3V211 115 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 NDUFA3O95167 84 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 HTD2P86397 168 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 LY6G6FQ5SQ64 297 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 CDH26Q8IXH8 852 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 OR52L2PQ8NGH6 319 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 SELENOIQ9C0D9 397 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.39■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 IRGMA1A4Y4 181 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 YPEL1O60688 119 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 RGS11O94810 467 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 MGMTP16455 207 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 FUT3P21217 361 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 SLURP1P55000 103 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 C19orf54Q5BKX5 351 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 AWAT2Q6E213 333 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 YPEL2Q96QA6 119 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 SLC29A1Q99808 456 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 TOLLIPQ9H0E2 274 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 BANF2Q9H503 90 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 PALMDQ9NP74 551 aa20.38■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PN81 502 aa20.37■□□□□ 0.85
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PBRM1-218ENST00000458294 MYL12AP19105 171 aa20.37■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 CHRNA7P36544 502 aa20.37■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
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PBRM1-218ENST00000458294 ACSM6Q6P461 480 aa20.37■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 Q96M66 194 aa20.37■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 TPSG1Q9NRR2 321 aa20.37■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 UBE2QL1A1L167 161 aa20.36■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 OR8U9P0C7N5 309 aa20.36■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 FAM71F2Q6NXP2 309 aa20.36■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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PBRM1-218ENST00000458294 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 STARD9Q9P2P6 4700 aa20.36■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa20.35■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa20.35■□□□□ 0.85
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PBRM1-218ENST00000458294 ARPC1AQ92747 370 aa20.35■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 GALMQ96C23 342 aa20.35■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 PGLYRP3Q96LB9 341 aa20.35■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 FBXO7Q9Y3I1 522 aa20.35■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC42Q9Y546 428 aa20.35■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 BIRC6Q9NR09 4857 aa20.35■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa20.34■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 A0A087WW49 117 aa20.34■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 LCE6AA0A183 80 aa20.34■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.34■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 PDCD6O75340 191 aa20.34■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 OR3A3P47888 321 aa20.34■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 PYHIN1Q6K0P9 492 aa20.34■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.34■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 OR2AK2Q8NG84 335 aa20.34■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 OR14A2Q96R54 314 aa20.34■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 PITPNAQ00169 270 aa20.33■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 MED21Q13503 144 aa20.33■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 C5orf24Q7Z6I8 188 aa20.33■□□□□ 0.85
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.33■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 CLEC2DQ9UHP7 191 aa20.33■□□□□ 0.85
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PPK0 400 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 DYNC1I1O14576 645 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 CAPGP40121 348 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 CX3CL1P78423 397 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 NKAIN3Q8N8D7 197 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 CYYR1Q96J86 154 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 OR4C12Q96R67 309 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 TM2D3Q9BRN9 247 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 IFI27L2Q9H2X8 130 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 PIPOXQ9P0Z9 390 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 RNF150Q9ULK6 438 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 CSMD3Q7Z407 3707 aa20.32■□□□□ 0.84
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