RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 NAPSAO96009 420 aa11.94□□□□□ -0.5
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CITED1-204ENST00000427412 LEUTXA8MZ59 168 aa11.91□□□□□ -0.5
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CITED1-204ENST00000427412 SCTP09683 121 aa11.91□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 CEACAM3P40198 252 aa11.91□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 RORCP51449 518 aa11.91□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.91□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.91□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 MALSU1Q96EH3 234 aa11.91□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.91□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 JPT1Q9UK76 154 aa11.91□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.91□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 HSPA12AO43301 675 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 FCER2P06734 321 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 PTHLHP12272 177 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 CD24P25063 80 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 IL3RAP26951 378 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 DYNLT3P51808 116 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 ARL6IP1Q15041 203 aa11.9□□□□□ -0.5
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CITED1-204ENST00000427412 TMEM219Q86XT9 240 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 ISOC1Q96CN7 298 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 PRSS22Q9GZN4 317 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 DIABLOQ9NR28 239 aa11.9□□□□□ -0.5
CITED1-204ENST00000427412 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.89□□□□□ -0.51
CITED1-204ENST00000427412 FAM25AB3EWG3 89 aa11.89□□□□□ -0.51
CITED1-204ENST00000427412 FAM25CB3EWG5 89 aa11.89□□□□□ -0.51
CITED1-204ENST00000427412 FAM25GB3EWG6 89 aa11.89□□□□□ -0.51
CITED1-204ENST00000427412 TRDCB7Z8K6 153 aa11.89□□□□□ -0.51
CITED1-204ENST00000427412 K7EIL1 84 aa11.89□□□□□ -0.51
CITED1-204ENST00000427412 HSD17B6O14756 317 aa11.89□□□□□ -0.51
CITED1-204ENST00000427412 BET1O15155 118 aa11.89□□□□□ -0.51
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