RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421365.2

IFIH1-202, Transcript of interferon induced with helicase C domain 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IFIH1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1-202ENST00000421365 KLK11Q9UBX7 282 aa14.65□□□□□ -0.06
IFIH1-202ENST00000421365 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.65□□□□□ -0.06
IFIH1-202ENST00000421365 GABARAPH6UMI1 98 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 J3QR06 171 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 TOR1AO14656 332 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 CTDSPLO15194 276 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 HSPA12AO43301 675 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 CRLF1O75462 422 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 IGLV1-47P01700 117 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 SRD5A1P18405 259 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 EPHA1P21709 976 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 ZBTB25P24278 435 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 ZNF134P52741 427 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 SRRQ9GZT4 340 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.64□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 A0A0U1RQK1 487 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 YPEL1O60688 119 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 NAT1P18440 290 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 PAX6P26367 422 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 CEACAM6P40199 344 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 ARPC4P59998 168 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 YPEL2Q96QA6 119 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 HLA-DMAP28067 261 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 PYDC2Q56P42 97 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 ZNF596Q8TC21 504 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 AJUBAQ96IF1 538 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 MMP28Q9H239 520 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 RDH8Q9NYR8 311 aa14.63□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 LANCL1O43813 399 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 RBBP9O75884 186 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 RCVRNP35243 200 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 PRRX1P54821 245 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 LGALS4P56470 323 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 BPIFB3P59826 476 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 Q3ZCU0 254 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 MIDNQ504T8 468 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 NEURL2Q9BR09 285 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 GINS4Q9BRT9 223 aa14.62□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 RGS11O94810 467 aa14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 DIRAS3O95661 229 aa14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 PMP2P02689 132 aa14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 CTXN2P0C2S0 81 aa14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 LINC00311Q8N616 119 aa14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 SLC6A7Q99884 636 aa14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 ST8SIA5O15466 376 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 IL7P13232 177 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 HTR1DP28221 377 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 RFX2P48378 723 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 ACTBP60709 375 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 ACTG1P63261 375 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 CADM3Q8N126 398 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 CUBNO60494 3623 aa14.6□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 FAM157CP0CG43 387 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 HRH1P35367 487 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 CDK10Q15131 360 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 Q8N402 240 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 DPM3Q9P2X0 92 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 OR5H8P0DN80 308 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 TAS2R46P59540 309 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 SSX2Q16385 188 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.59□□□□□ -0.07
IFIH1-202ENST00000421365 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms