RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLURP1P55000 103 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNMTQ14749 295 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB12Q6IQ22 244 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR13C5Q8NGS8 318 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RITA1Q96K30 269 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CITED4Q96RK1 184 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NABP2Q9BQ15 211 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2S2Q9NQN1 319 aa10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SC5DO75845 299 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDPQ00604 133 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECSCRQ19T08 205 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MORN2Q502X0 79 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSM6Q6P461 480 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APH1BQ8WW43 257 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARPC1AQ92747 370 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM19Q96E16 107 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOLLIPQ9H0E2 274 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GHITMQ9H3K2 345 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF9BQ9HBM6 251 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1456Q9P272 454 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JPT1Q9UK76 154 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEX16Q9Y5Y5 336 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087WW49 117 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PN81 502 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX15O60248 233 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA11O75493 328 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFA3O95167 84 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFAIP8O95379 198 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8U9P0C7N5 309 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRNA7P36544 502 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2G6Q5TZ20 316 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIN54Q6MZP7 749 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHRSXQ8N5I4 330 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPBQ8NG41 125 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52L2PQ8NGH6 319 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUL1Q969V5 352 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CST11Q9H112 138 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CKLFQ9UBR5 152 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO7Q9Y3I1 522 aa10.17□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A6NHS1 94 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A7PA6NKC0 464 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPX5O75715 221 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSTP19883 344 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETV1P50549 477 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PITPNAQ00169 270 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOC2BQ14184 412 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q499Y3 187 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AWAT2Q6E213 333 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFAND6Q6FIF0 208 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JAGN1Q8N5M9 183 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYYR1Q96J86 154 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RDH12Q96NR8 316 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNIP1Q9NZI2 227 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.16□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2QL1A1L167 161 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OGG1O15527 345 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LALBAP00709 142 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGMTP16455 207 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPGP40121 348 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR3A3P47888 321 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTD2P86397 168 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf24Q7Z6I8 188 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASTOR1Q8WTX7 329 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYGBQ8WWM9 190 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISOC1Q96CN7 298 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SELENOIQ9C0D9 397 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BANF2Q9H503 90 aa10.15□□□□□ -0.78
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms