RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A0B4J293	547 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1W2PPE2	198 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1W2PR64	198 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1W2PRV1	198 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		M0R1W7	72 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PI3	P19957	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RAG2	P55895	527 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	TAS2R31	P59538	309 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PAX2	Q02962	417 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	UTF1	Q5T230	341 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		Q96MF0	132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	BEX2	Q9BXY8	128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	BEX1	Q9HBH7	125 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PSG11	Q9UQ72	335 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1B0GVG6	124 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ITGB1BP1	O14713	200 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	HSD17B6	O14756	317 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ST8SIA5	O15466	376 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	DHFR	P00374	187 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	OR8U9	P0C7N5	309 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	GNG10	P50151	68 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	FOXC2	Q99958	501 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	OR2D2	Q9H210	308 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A087X0M5	115 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1B0GX30	115 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	GPR31	O00270	319 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC31A2	O15432	143 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PRAF2	O60831	178 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	AKR1C4	P17516	323 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	GNRHR	P30968	328 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RAB7A	P51149	207 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ARF6	P62330	175 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		Q3ZCU0	254 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	C4orf46	Q504U0	113 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		Q8N7P7	452 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM230	Q96A57	120 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	REG4	Q9BYZ8	158 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	MMP26	Q9NRE1	261 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RNF150	Q9ULK6	438 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	KPTN	Q9Y664	436 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ALG5	Q9Y673	324 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ZFHX3	Q15911	3703 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	NF1	P21359	2839 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	CR1	P17927	2039 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1W2PPE3	182 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	MSMB	P08118	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	OR4E1	P0C645	316 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FAAP20-208	ENST00000420964	CD34	P28906	385 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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