RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF383Q8NA42 475 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 FRZBQ92765 325 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 LAMA5O15230 3695 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 BTBD17A6NE02 478 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 C9orf172C9J069 976 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 RAMP3O60896 148 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 CER1O95813 267 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 OR2H2O95918 312 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 IGKV1D-33P01593 117 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 IGKV1-33P01594 117 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 BCL2P10415 239 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 CEACAM1P13688 526 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 GNG3P63215 75 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 PLP2Q04941 152 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 DEFB127Q9H1M4 99 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 RBKSQ9H477 322 aa11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 CDIPTO14735 213 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 IL18BPO95998 194 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 TRGC1P0CF51 173 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 TDGF1P13385 188 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 APLNRP35414 380 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 Q6P435 159 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 OR8G5Q8NG78 346 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 OR4C12Q96R67 309 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 LINC00470Q9BZP3 86 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 A0A1B0GU03 582 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 DFFBO76075 338 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 GRPP07492 148 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 CTXN2P0C2S0 81 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 S100PP25815 95 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 CEACAM6P40199 344 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 KHDC3LQ587J8 217 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 ABHD14BQ96IU4 210 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 RHOVQ96L33 236 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 OR51I2Q9H344 312 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 TECTAO75443 2155 aa11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CNGA3-204ENST00000409937 LAMTOR5O43504 91 aa11.9□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 IGHEP01854 428 aa11.9□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 CLN3Q13286 438 aa11.9□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.9□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 DRAM1Q8N682 238 aa11.9□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 WDYHV1Q96HA8 205 aa11.9□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 SNX22Q96L94 193 aa11.9□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.9□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 SLC25A22Q9H936 323 aa11.9□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 WNT9BO14905 357 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 CLDN1O95832 211 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 KRASP01116 189 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 HBE1P02100 147 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 PGA5P0DJD9 388 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 S100GP29377 79 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 G6PCP35575 357 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF573Q86YE8 665 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 C5orf30Q96GV9 206 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 FAM210BQ96KR6 192 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 RAB40CQ96S21 281 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 CLN8Q9UBY8 286 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 IL17BQ9UHF5 180 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 TTC28Q96AY4 2481 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 A0A087WWC5 75 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 FABP4P15090 132 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 TUBG1P23258 451 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 S100A2P29034 98 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 RTP5Q14D33 572 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 SLC35E3Q7Z769 313 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 OR1L1Q8NH94 360 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 IL22RA2Q969J5 263 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.89□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 B4E171 279 aa11.88□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 YKT6O15498 198 aa11.88□□□□□ -0.51
CNGA3-204ENST00000409937 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms