RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 CCL13Q99616 98 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ZFP57Q9NU63 452 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 JMJD1CQ15652 2540 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 H0Y980 276 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TMPRSS2O15393 492 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 PI3P19957 117 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 SSTR2P30874 369 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 RAB7AP51149 207 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 EDDM3BP56851 147 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 H2BFSP57053 126 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM33P57088 247 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 EDDM3AQ14507 147 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 FAM201AQ5SY85 155 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 OR1L1Q8NH94 360 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 RAB1CQ92928 201 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TIMD4Q96H15 378 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf50Q96LR7 162 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM56Q96MV1 263 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 CALYQ9NYX4 217 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 COMMD9Q9P000 198 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 CLN8Q9UBY8 286 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 MIOXQ9UGB7 285 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 DYSFO75923 2080 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PPH5 198 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 C19orf84I3L1E1 186 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ADAM20O43506 726 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 RP2O75695 350 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV2-70P01814 119 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 PET100P0DJ07 73 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A4P12235 298 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 CD99P14209 185 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 RPA2P15927 270 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 F2RP25116 425 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 UCP1P25874 307 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM65Q6PI78 240 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 PRR18Q8N4B5 295 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 C18orf12Q96KH6 178 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 CHODLQ9H9P2 273 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 C5orf51A6NDU8 294 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ATG12O94817 140 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 CDS2O95674 445 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 SOD3P08294 240 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 OR5AC1P0C628 307 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A6P12236 298 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 COL8A2P25067 703 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 LOXL3P58215 753 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 MORN2Q502X0 79 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 SPIN2AQ99865 258 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 CHIAQ9BZP6 476 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 STAB1Q9NY15 2570 aa8.11□□□□□ -1.11
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