RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 MOB1BQ7L9L4 216 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SPARTQ8N0X7 666 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OR4X2Q8NGF9 303 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 IL1F10Q8WWZ1 152 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 YPEL2Q96QA6 119 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 STEAP1Q9UHE8 339 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 LDLRAD4O15165 306 aa16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 LANCL1O43813 399 aa16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MOSP00540 346 aa16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMB9P28065 219 aa16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 RANBP1P43487 201 aa16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 HSF4Q9ULV5 492 aa16.03■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMB11A5LHX3 300 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM50BP56557 158 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PLA2G7Q13093 441 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 LY6G6FQ5SQ64 297 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 C22orf42Q6IC83 251 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2AK2Q8NG84 335 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OR56B1Q8NGI3 324 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PECRQ9BY49 303 aa16.02■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CMYA5Q8N3K9 4069 aa16.02■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SERPINE3A8MV23 424 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 GALP22466 123 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 LSAMPQ13449 338 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC35E3Q7Z769 313 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF329Q86UD4 541 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 Q8N9W7 124 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 FCGR1BQ92637 280 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 C12orf4Q9NQ89 552 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 LINC00527Q9UJ94 153 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB22AQ9UL26 194 aa16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 IFITM5A6NNB3 132 aa16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHG2P01859 326 aa16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB3BP20337 219 aa16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 OR3A3P47888 321 aa16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 HLA-DRB3P79483 266 aa16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 PLAC9Q5JTB6 97 aa16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 CHPT1Q8WUD6 406 aa16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 S1PR3Q99500 378 aa16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 PLSCR3Q9NRY6 295 aa16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 LINC01548A6NM66 108 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 G3V4G9 280 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ST8SIA5O15466 376 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 PF4V1P10720 104 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 OR8H1Q8NGG4 311 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 RASL11BQ9BPW5 248 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCG5Q9H222 651 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 IFI27L2Q9H2X8 130 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 Q9N2K0 584 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 NOTCH1P46531 2555 aa15.99■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0B4J203 849 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SMIM30A4D0T7 59 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR12P47775 334 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 F2RL1P55085 397 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF773Q6PK81 442 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 NR2C2APQ86WQ0 139 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 NABP2Q9BQ15 211 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SCTP09683 121 aa15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 MOGAT2Q3SYC2 334 aa15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SAMD5Q5TGI4 173 aa15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 STPG2Q8N412 459 aa15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB3CQ96E17 227 aa15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 PIPOXQ9P0Z9 390 aa15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 STUB1Q9UNE7 303 aa15.97■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 AP4M1O00189 453 aa15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 HSPA12AO43301 675 aa15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 CD3GP09693 182 aa15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB6AP20340 208 aa15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB25P24278 435 aa15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC35B1P78383 322 aa15.96■□□□□ 0.15
ANKRD39-201ENST00000393537 OR10R2Q8NGX6 335 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms