RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 GPR12P47775 334 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 PRRX1P54821 245 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 LOXL3P58215 753 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 Q3ZCU0 254 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 LY6G6FQ5SQ64 297 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZNX1 250 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 SGPP2Q8IWX5 399 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF645Q8N7E2 425 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 OR13D1Q8NGV5 346 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 AKR1E2Q96JD6 320 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 FOXC2Q99958 501 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 BEX2Q9BXY8 128 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 REG4Q9BYZ8 158 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 BEX1Q9HBH7 125 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 PSG11Q9UQ72 335 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 KPTNQ9Y664 436 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 VGLL3A8MV65 326 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 B4DSR2 109 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 RNF223E7ERA6 249 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ITGB1BP1O14713 200 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ST8SIA5O15466 376 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 MMP23AO75900 390 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 MSMBP08118 114 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 PI3P19957 117 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 VAMP1P23763 118 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 IL3RAP26951 378 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 DLX6P56179 175 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 PIGPP57054 158 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 CBX3Q13185 183 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 TATDN3Q17R31 274 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 PHLDA2Q53GA4 152 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ABHD12Q8N2K0 398 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ZBTB34Q8NCN2 500 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 LEAP2Q969E1 77 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 MRGPRFQ96AM1 343 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 RSRP1Q9BUV0 290 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM133Q9H2Q1 129 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 GHITMQ9H3K2 345 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 CCL28Q9NRJ3 127 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 PIPOXQ9P0Z9 390 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 RNF150Q9ULK6 438 aa10□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ROS1P08922 2347 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 LRBAP50851 2863 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 RNF212BA8MTL3 300 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 TOX4O94842 621 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 IL5P05113 134 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 OR4E1P0C645 316 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ANXA3P12429 323 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 CATR1Q13166 79 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 LYG1Q8N1E2 194 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 OR9G1Q8NH87 305 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF596Q8TC21 504 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 PCGF1Q9BSM1 259 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 SIRT7Q9NRC8 400 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PPE3 182 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 J3QR06 171 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 RAB29O14966 203 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 COX7A1P24310 79 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 GNRHRP30968 328 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRK-201ENST00000368202 MSMO1Q15800 293 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms