RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 HES1Q14469 280 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 HNF4GQ14541 408 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ABCA11PQ4W5N1 156 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 LYG1Q8N1E2 194 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RAB3CQ96E17 227 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 YIPF6Q96EC8 236 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 YPEL2Q96QA6 119 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 Q9N2K0 584 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ABRACLQ9P1F3 81 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 A0A075B6Q4 140 aa11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 SCTP09683 121 aa11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 FAM106CPP0CH98 169 aa11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM11P17152 192 aa11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 PTX4Q96A99 478 aa11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 MOB4Q9Y3A3 225 aa11.89□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 MGAM2Q2M2H8 2515 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ST8SIA5O15466 376 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 LPLP06858 475 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM18P0DKX4 95 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 EBI3Q14213 229 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 HERPUD1Q15011 391 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 LY6G6FQ5SQ64 297 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 STEAP3Q658P3 488 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf88Q6PI97 169 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 IZUMO1Q8IYV9 350 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 MAFIPQ8WZ33 124 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 WNT10AQ9GZT5 417 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 IFI27L2Q9H2X8 130 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 SLC23A1Q9UHI7 598 aa11.88□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 METTL21EPA6NDL7 271 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 LANCL1O43813 399 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 RGS11O94810 467 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 FCGR3AP08637 254 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 CD3GP09693 182 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 OR3A3P47888 321 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 LSM3P62310 102 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 Q8N6K4 173 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 DTX3Q8N9I9 347 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 OR2AK2Q8NG84 335 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 MGAT4AQ9UM21 535 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 VWFP04275 2813 aa11.87□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 TRDCB7Z8K6 153 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 TXNL1O43396 289 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 AIREO43918 545 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 TSPAN15O95858 294 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 CD28P10747 220 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 CD1BP29016 333 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 LSAMPQ13449 338 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf152Q5JTZ5 239 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 IDNKQ5T6J7 187 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 TREML4Q6UXN2 200 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.86□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 SERPINE3A8MV23 424 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 M0QZ24 198 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 M0QZK8 103 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 CDNFQ49AH0 187 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 RPL39P5Q59GN2 51 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 OR2T10Q8NGZ9 312 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ABHD14BQ96IU4 210 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 NABP2Q9BQ15 211 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF251Q9BRH9 671 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 AGMATQ9BSE5 352 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM235A6NFC5 223 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 FABP7O15540 132 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 HSPA12AO43301 675 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 FGF16O43320 207 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 PEX14O75381 377 aa11.84□□□□□ -0.51
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO24O75426 580 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms