RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 FBP1P09467 338 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 ZBTB25P24278 435 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 HTR1DP28221 377 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 IL18Q14116 193 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 IGSF11Q5DX21 431 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 PYHIN1Q6K0P9 492 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 C17orf50Q8WW18 174 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 SNAPC3Q92966 411 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 ABHD1Q96SE0 405 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 PRDM13Q9H4Q3 707 aa16.36■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 A0A1W2PPE3 182 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC31A2O15432 143 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 HSPA12AO43301 675 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 WIPF1O43516 503 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 JMJD8Q96S16 334 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 TOLLIPQ9H0E2 274 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM96BQ9Y3D0 163 aa16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 BET1O15155 118 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 CTDSPLO15194 276 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 NAT1P18440 290 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 ARPC4P59998 168 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 CT45A1Q5HYN5 189 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC190Q86UF4 302 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 LDLRAD3Q86YD5 345 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 OR10J5Q8NHC4 309 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 CT45A3Q8NHU0 189 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 MALSU1Q96EH3 234 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 SOSTQ9BQB4 213 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 DPM3Q9P2X0 92 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 V9GYH0 126 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-202ENST00000319107 LEUTXA8MZ59 168 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 GABARAPH6UMI1 98 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ITGB1BP1O14713 200 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 FCER2P06734 321 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 CTXN2P0C2S0 81 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 RCVRNP35243 200 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 CEACAM3P40198 252 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 CEACAM6P40199 344 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF134P52741 427 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 OR2AK2Q8NG84 335 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 OR10X1Q8NGY0 326 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 OR52I2Q8NH67 350 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 SMIM4Q8WVI0 70 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 EDARADDQ8WWZ3 215 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 GINS4Q9BRT9 223 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 RDH8Q9NYR8 311 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 FABP12A6NFH5 140 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 LY6LH3BQJ8 138 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 IL3RAP26951 378 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF137PP52743 207 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ACTBP60709 375 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ACTG1P63261 375 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 DGCR2P98153 550 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM131AQ6UXB0 335 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 Q6YL49 198 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 OR5AP2Q8NGF4 316 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ZFAND2BQ8WV99 257 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 IFI27L2Q9H2X8 130 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 PTTG2Q9NZH5 202 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 RAB7AP51149 207 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 TAS2R46P59540 309 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 HILS1P60008 231 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 SSX2Q16385 188 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 TOMM40LQ969M1 308 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 RPEQ96AT9 228 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 MTFP1Q9UDX5 166 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 HILPDAQ9Y5L2 63 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 OOSP1A8MZH6 123 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 HSD17B6O14756 317 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ST8SIA5O15466 376 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 PAX6P26367 422 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP16.3■□□□□ 0.21e-10■■■■■ 33
RALGPS1-202ENST00000319107 ETV6P41212 452 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 CDK10Q15131 360 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF79Q15937 498 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM216AQ8WUB2 273 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms