RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 PITPNAQ00169 270 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 YPEL2Q96QA6 119 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 A6NHS1 94 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 HSPA12AO43301 675 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ZBTB25P24278 435 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 TNFSF8P32971 234 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OR3A3P47888 321 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 LY6EQ16553 131 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 Q6ZS49 121 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00311Q8N616 119 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 BEST4Q8NFU0 473 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 AGMATQ9BSE5 352 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RAB9BQ9NP90 201 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RNF150Q9ULK6 438 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PPI3 338 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 POM121CA8CG34 1229 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 LEUTXA8MZ59 168 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 J3QRK9 145 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 PROP1O75360 226 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 PRSS3P35030 304 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 KIR2DS4P43632 304 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00205P59089 165 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 KIR2DS1Q14954 304 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 STEAP3Q658P3 488 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 HOGA1Q86XE5 327 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 LYG1Q8N1E2 194 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 GPX8Q8TED1 209 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RDH8Q9NYR8 311 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 KLK11Q9UBX7 282 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 TIMM23O14925 209 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM219Q86XT9 240 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OR52I2Q8NH67 350 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OR56B4Q8NH76 319 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 TOMM40LQ969M1 308 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RPEQ96AT9 228 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 MDFIQ99750 246 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0A6YYJ9 748 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 VGLL3A8MV65 326 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 HSD17B6O14756 317 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 LPLP06858 475 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OR8U9P0C7N5 309 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RFX2P48378 723 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 DGCR2P98153 550 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 Q3ZCU0 254 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 DRAM1Q8N682 238 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OR8U1Q8NH10 309 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CFHR4Q92496 578 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 C5orf30Q96GV9 206 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 SOSTQ9BQB4 213 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 MMP27Q9H306 513 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 STAB1Q9NY15 2570 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CLDN34H7C241 214 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms