RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1B0GU03 582 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 THBS3P49746 956 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GPR35Q9HC97 309 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CACNA1AO00555 2505 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 H0Y8G0 127 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CYC1P08574 325 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GPR12P47775 334 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 FAM166AQ6J272 317 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 BOD1Q96IK1 185 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 AQP7O14520 342 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 IGHMP01871 453 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 FAM157CP0CG43 387 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 PSG2P11465 335 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 FOLR2P14207 255 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PPE3 182 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 HSBP1O75506 76 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 SERF2P84101 59 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 VPS25Q9BRG1 176 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 BCL3P20749 454 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 MPZP25189 248 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 MANBALQ9NQG1 85 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 SLC31A2O15432 143 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF883P0CG24 379 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 AMTP48728 403 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 Q8WTZ3 238 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TBX15Q96SF7 602 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 F2RP25116 425 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.73□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 APOA2P02652 100 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 OR10J1P30954 320 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 ATP6V1FQ16864 119 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 SCTP09683 121 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 COL19A1Q14993 1142 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TP53RKQ96S44 253 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 C9orf172C9J069 976 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CA11O75493 328 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 NGFP01138 241 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GCGP01275 180 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GYPAP02724 150 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 AGAP20933 346 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 RFESDQ8TAC1 157 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 A0A0G2JMM0 328 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PPB8 328 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PRS3 328 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 IGSF23A1L1A6 192 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 KIR3DP1A8MWS1 328 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 M0QZK8 103 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CELA3AP09093 270 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 OR5I1Q13606 314 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 FHL1Q13642 323 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CSRP2Q16527 193 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GALNT14Q96FL9 552 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 DECR2Q9NUI1 292 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 FAM27BQ5VT28 67 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 PIEZO1Q92508 2521 aa14.71□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 LDLRAD4O15165 306 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 PAX5Q02548 391 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms