RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 OR10A7Q8NGE5 316 aa12.66□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 OR1K1Q8NGR3 316 aa12.66□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 FREM1Q5H8C1 2179 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 TRAV39A0A0B4J263 110 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 DEGS1O15121 323 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 ZNF737O75373 536 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 SPANXN5Q5MJ07 72 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 FAM58AQ8N1B3 248 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 UFSP2Q9NUQ7 469 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 NAT8Q9UHE5 227 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 SMCO3A2RU48 225 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 IFNA1P01562 189 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 IGKV1D-33P01593 117 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 IGKV1-33P01594 117 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 PFN1P07737 140 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 COX5BP10606 129 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 OTX2P32243 289 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 TCEAL6Q6IPX3 200 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 C16orf82Q7Z2V1 217 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 TMEM183AQ8IXX5 376 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 SRD5A3Q9H8P0 318 aa12.65□□□□□ -0.38
SYP-201ENST00000263233 LRP5LA4QPB2 252 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 SRYQ05066 204 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 ADIRFQ15847 76 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 NCR3LG1Q68D85 454 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 TUSC5Q8IXB3 177 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 OR5R1Q8NH85 324 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 MEGF10Q96KG7 1140 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 POM121L2Q96KW2 1035 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 SMIM7Q9BQ49 75 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 AGMATQ9BSE5 352 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GV90 55 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 TSTD3H0UI37 97 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 RHBDL1O75783 438 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 PMS2P11Q13670 270 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 IGFBP7Q16270 282 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 PRR18Q8N4B5 295 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 LHX4Q969G2 390 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 PYGO2Q9BRQ0 406 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 PRSS50Q9UI38 385 aa12.64□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 A0A087X0M5 115 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GX30 115 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 IFNA10P01566 189 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 COL10A1Q03692 680 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 Q6P435 159 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 ZNF573Q86YE8 665 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 NECAP1Q8NC96 275 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 GPR87Q9BY21 358 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 STRADBQ9C0K7 418 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 TMEM9BQ9NQ34 198 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 SLC39A9Q9NUM3 307 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 PAX1P15863 534 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 GNG3P63215 75 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 SLC38A11Q08AI6 406 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 TMEM241Q24JQ0 296 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 SSX9Q7RTT3 188 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 UBALD1Q8TB05 177 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 SMOC1Q9H4F8 434 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 PILRBQ9UKJ0 227 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 KCNS2Q9ULS6 477 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 GAB2Q9UQC2 676 aa12.63□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 KBTBD11O94819 623 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 AMBPP02760 352 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 GZMHP20718 246 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 CYB561P49447 251 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 RPL23P62829 140 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 TLE1Q04724 770 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 OR5B21A6NL26 309 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 DVL1O14640 695 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 SSTP61278 116 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 HNF4GQ14541 408 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 BSXQ3C1V8 233 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 SPINK14Q6IE38 97 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 OR8G2PQ6IF36 304 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 ACSM6Q6P461 480 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 OR1P1Q8NH06 330 aa12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SYP-201ENST00000263233 LAMP3Q9UQV4 416 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms