RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 HSPB8Q9UJY1 196 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 A6NDN8 102 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 K7ERU9 68 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 P01737 135 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 MESP2Q0VG99 397 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 CEACAM21Q3KPI0 293 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 MOB3BQ86TA1 216 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 MKRN2OSH3BPM6 223 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 RIGQ13278 110 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF506Q5JVG8 444 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 VWA1Q6PCB0 445 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 CLN8Q9UBY8 286 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 TCF21O43680 179 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 LYRM7Q5U5X0 104 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 OR52M1Q8NGK5 317 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 WDR54Q9H977 334 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 ALKBH6Q3KRA9 238 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 IER2Q9BTL4 223 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 NPVFQ9HCQ7 196 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 A0A1B0GTI1 187 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 A0A1W2PR80 420 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 PPOXP50336 477 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 TUSC5Q8IXB3 177 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 ADIPOR1Q96A54 375 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 SH3BGRL3Q9H299 93 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 MSGN1A6NI15 193 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 NDUFB4O95168 129 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 PMCHL1Q16048 86 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 DHRS13Q6UX07 377 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 MT-CO3P00414 261 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 ADRA2AP08913 450 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 ORM2P19652 201 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
HOXA13-201ENST00000222753 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 PSG4Q00888 419 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 GPR146Q96CH1 333 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 UQCR10Q9UDW1 63 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM250H0YL14 139 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 EGR4Q05215 589 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 OR4C12Q96R67 309 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 PLXNB2O15031 1838 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 SYNGR1O43759 233 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 LYZL6O75951 148 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 SCTP09683 121 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 IL9P15248 144 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 SPNS3Q6ZMD2 512 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM183AQ8IXX5 376 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 HPRT1P00492 218 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 HLA-DQA1P01909 254 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 COL8A1P27658 744 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 FHITP49789 147 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 GABRA6Q16445 453 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 ABHD3Q8WU67 409 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 A0A0J9YW62 118 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 LNP1A1A4G5 178 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 KBTBD11O94819 623 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 C1orf210Q8IVY1 113 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 TRAV39A0A0B4J263 110 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM229AB2RXF0 380 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF785A8K8V0 405 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 CSN3P07498 182 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 PXMP4Q9Y6I8 212 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 IGHV4-34P06331 123 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 AGAP20933 346 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 GALNT14Q96FL9 552 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 TINAGQ9UJW2 476 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 UNC119Q13432 240 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 Q56UQ5 140 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 SMRP1Q8NCR6 262 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 PERPQ96FX8 193 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 WASHC3Q9Y3C0 194 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 A0A087WWC5 75 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF83P51522 516 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 RPL24P83731 157 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 SAXO1Q8IYX7 474 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXA13-201ENST00000222753 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms