RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr446Q8VEV0 308 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1309Q8VF83 320 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1086Q8VFL9 310 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med6Q921D4 246 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933400A11RikQ9CR52 288 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9CWB7 115 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr943Q9EQ92 314 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm42791D3YYB5 209 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rabl2E9Q9D5 223 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdf1P20863 357 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Upk2P38575 184 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr1dP97304 133 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr135Q7TQP2 457 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BTC1 67 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ntng2Q8R4F1 589 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr559Q8VH14 318 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd209cQ91ZW9 178 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif1bQ9CXU9 113 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r1aQ9ERT9 171 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nubp2Q9R061 275 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Flg2Q2VIS4 2362 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tln1P26039 2541 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RnlsA7RDN6 342 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam98cE9PYD1 344 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DaoP18894 345 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasd2P63032 266 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 N4bp2l1Q3V2Q8 238 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nkain2Q4PNJ2 208 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pif1Q80SX8 650 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35e1Q8CD26 409 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WrbQ8K0D7 174 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrgpra6Q91ZC6 301 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec11cQ9D8V7 192 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tceal6Q9DB24 200 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk20Q9JHU3 346 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Angptl4Q9Z1P8 410 aa11□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D430019H16RikJ3QPM6 83 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r66K7N6R9 851 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cbr2P08074 244 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Meox2P32443 303 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FauP35545 74 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lbx1P52955 282 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist1h2baP70696 127 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Commd3Q63829 195 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf144bQ8BKD6 301 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Las2Q8CB14 526 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r235Q8R297 328 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r19Q8R2C7 308 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd6lQ8R3N2 586 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1279Q8VF38 313 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1038Q8VGS1 319 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufa6Q9CQZ5 131 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r35Q9D8C8 260 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fscn3Q9QXW4 498 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MsmpB1AWI6 139 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9125P0DMR6 365 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab3cP62823 227 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CycsP62897 105 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r15Q14C10 299 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf9bQ6NZA9 249 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tssk5Q8C1R0 372 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1411Q8VFC4 323 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcdin3dQ91YP1 285 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OxsmQ9D404 459 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exosc8Q9D753 276 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GlceQ9EPS3 618 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mlf1Q9QWV4 267 aa10.99□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sptbn2Q68FG2 2388 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp456B2RUK9 458 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem200bD3Z0P8 284 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smr2O09133 150 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MpgQ04841 333 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem69Q3KQJ0 245 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iqcf4Q6P8Y2 204 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam57bQ7TNV1 275 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp819Q80V81 607 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prrg4Q8BGN6 226 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r211Q8R266 298 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MynnQ99MD8 610 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tm7sf3Q9CRG1 565 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MrnipQ9D1F5 335 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf19Q9JLL3 416 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BlnkQ9QUN3 457 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TpbgQ9Z0L0 426 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1438-ps1A0A140LHS9 319 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prrt2E9PUL5 346 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PlatP11214 559 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyb5aP56395 134 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6899Q3USS0 134 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frem1Q684R7 2191 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh2d7Q8BI17 458 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep41Q99NF3 373 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TsfmQ9CZR8 324 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snu13Q9D0T1 128 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rarres2Q9DD06 162 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syt6Q9R0N8 511 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lhx2Q9Z0S2 406 aa10.98□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr455A0A0B4J1M2 317 aa10.97□□□□□ -0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss39O70169 367 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65 ms